「火車和音樂其實是一件事，都是流動的事物，流動的感覺。」這是侯孝賢難得提到的聲音和影像的結合，從電影和對談中，我窺見了台灣電影創作者的奧妙心靈。
「坐咖啡廳就像坐火車一樣，」侯孝賢表示：「幌啊幌的，那種平穩的節奏，人就恍神了，很容易就會睡著，就會有很多影像浮現了開來。」
火車是侯孝賢電影中很特別的景像，「悲情城市」最驚心動魄的二二八衝突發生在火車上，梁朝偉和辛樹芬搭車遠行的場面，又悲淒得讓人心酸，「戀戀風塵」裡的北台灣山水風景就隨著列車前行在我們眼前迄邐拉開……「南國，再見南國」如此，「咖啡時光」亦如此。人類伴隨著鐵道的科技文明所發展出來的城市和生活景觀，就這樣成為侯孝賢電影中最豐沛的文明動能。
面對大家的挖掘和探密，侯孝賢幽默表示，他愛火車是因為搭汽車會暈車，只能坐火車，月台上發生的送別、等待、重逢的故事一直都是當代人的生活重心之一，「只要有火車，我絕不放過。」常跑東京的侯導，夏日悶熱時他就會坐上火車去東京四處繞逛，看人看風景，這些經驗也就慢慢匯聚成「咖啡時光」的創作能源。
愛搭火車的侯孝賢最愛第火車頭的第一節車廂，一方面欣賞車前風景，一方面則是觀察駕駛員各種檢查儀器的制式動作，資深的隨意比畫，卻是鉅細靡遺，資淺的一舉一動都非常嚴謹，反應日本社會的嚴格紀律。
其實，侯孝賢對老式的交通工具情有獨鐘，他到香港不愛搭地鐵，只因他很享受坐渡輪往返九龍和香港的悠閒趣味，有時甚至還會一路換船搭乘，慢慢幌到一處不知名的小島上；對於自己成長的高雄哈馬星和旗津的渡輪感情，後來也轉化成為電影「風櫃來的人」的詩情畫面。
以東京為背景的「咖啡時光」中，侯孝賢首要的工作是拿出東京地圖，清楚界定男女主角生活的場域，東京許多的火車線道都已地下化了，但是他要的是老式的地面上的火車場景，所以選中了還有老式單節電車行駛的鬼子母站，然後再根據劇情需要規畫出神保町舊書店的生活場域，搞清楚劇中人物的現實面之後，才開始拍攝。
但也因為申請未獲同意，只能在默許的狀態下偷拍，所以「珈琲時光」不能把機器架到駕駛前來拍駕駛員的動作和神情，但是侯導充分掌握到東京鐵路連密亘延的特質，決定將山手線電車在田端站和京濱東北線的平行路段，列車交錯的畫面，拍成淺野忠信與一青窈的曼波互動，以及兩人殊途同歸，從兩列平行列車上終於得能相聚月台的人生機緣，拍成了讓人歎為觀止的互動天意。
「火車和音樂其實是一件事，都是流動的事物，流動的感覺。」侯孝賢說，他常在剪接或寫劇本時就會哼起不自覺地一些歌曲，情境常常就相當吻合電影韻味，副導建議他不妨拿起錄音機把歌聲錄下，就可以轉換成為配樂的內容，「可是，一拿起錄音機，聲音就停了，就唱不出來了！」侯孝賢笑著說靈感是勉強不來的，「我的創作方式是越放鬆就越敏感！」
「咖啡時光」中的配樂以江文也的台灣組曲為主，一方面是因為江文也是男女主角籌拍紀錄片的對象，聆聽他的音樂，有劇情的合理性，另一方面就在他們尋找江文也舊足跡的尋尋覓覓中，江文也的配樂不時浮現，也就有了魂魄飛揚的趣味功能，至於片尾一青窈時而日語時而漢語的「一思案」那首片尾曲，其實就是女主角本人所填的詞，充滿意像式的語法，既是她本人的輕歎，又是片中陽子角色的總回顧，建構出本片讓人回味無窮的迴旋空間。